革兰阴性杆菌可引起多种疾病。一些革兰阴性杆菌是肠道正常菌群的共生菌。这些共生菌以及来自动物或环境中的其他细菌都可以引起疾病。
腹泻, 腹膜炎以及 尿路感染、胃肠道、胆道和 血流 通常由革兰氏阴性杆菌引起。
革兰氏阴性细菌可引起 鼠疫, 霍乱, 和 伤寒。 这些感染在美国很少见,但在世界卫生条件差和/或水和食品供应不安全的地区更为常见。这些感染可非常严重。